sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-VQ-A8E3	1	61735	37228387	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	37228545	46623945	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	46625477	46764491	3	1
TCGA-VQ-A8E3	1	46766701	47501125	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	47501188	48077486	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	48077670	56734938	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	56735264	57138995	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	57139324	57746459	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	57747987	57786107	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	57786130	62272652	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	62275258	62430748	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	62432471	86475665	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	86482064	87304287	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	87304568	93229496	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	93231699	95452139	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	95452175	110753326	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	110754030	111175432	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	111178705	145994093	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	145994810	159774428	3	1
TCGA-VQ-A8E3	1	159776089	160181084	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	160181631	161871226	3	1
TCGA-VQ-A8E3	1	161872158	177748432	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	177748580	184983937	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	184983981	213377726	2	0
TCGA-VQ-A8E3	1	213378193	214589123	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	214589168	248930189	2	0
TCGA-VQ-A8E3	2	12784	433258	3	1
TCGA-VQ-A8E3	2	433274	3435431	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	3435528	4045661	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	4045824	10846265	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	10846500	11862756	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	11863307	19655174	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	19655302	21451532	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	21451879	23006818	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	23007354	23711946	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	23713633	41676748	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	41678412	43247533	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	43255905	45741445	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	45741848	47725092	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	47725638	62268074	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	62269405	63037612	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	63068581	67995149	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	67995221	68706707	3	1
TCGA-VQ-A8E3	2	68706744	75277489	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	75277851	75679050	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	75679498	80020860	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	80020875	109373831	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	109375752	109455791	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	109459100	118169379	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	118170144	122287385	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	122288145	126618414	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	126618674	131581438	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	131581548	137695159	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	137696238	138307433	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	138307553	158580276	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	158580501	159238249	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	159238575	164376227	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	164378977	166542068	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	166542411	176721990	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	176722020	177883441	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	177883481	205478335	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	205478802	205969093	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	205969194	207368878	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	207371526	208512085	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	208512240	215340761	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	215340932	220220089	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	220221009	229722732	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	229723078	230826069	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	230832937	234474623	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	234475300	235083104	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	235083212	242147305	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	18667	367815	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	367832	4807912	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	4809564	8414535	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	8414600	8853172	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	8854141	10293297	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	10293461	11032327	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	11034911	12885134	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	12887049	13876884	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	13883943	21640587	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	21641002	42198209	3	1
TCGA-VQ-A8E3	3	42202359	57929747	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	57929752	58744806	1	0
TCGA-VQ-A8E3	3	58748021	60223953	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	60224644	60497219	1	0
TCGA-VQ-A8E3	3	60501157	60539592	0	0
TCGA-VQ-A8E3	3	60541746	60559869	1	0
TCGA-VQ-A8E3	3	60560511	90208684	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	90209779	113217762	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	113218060	113298470	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	113299752	122888622	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	122890359	130214475	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	130214805	133198402	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	133201254	135175837	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	135178858	196245509	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	196246373	196948008	3	1
TCGA-VQ-A8E3	3	196949561	197714713	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	197720016	198169247	3	2
TCGA-VQ-A8E3	4	12281	9865878	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	9866969	10381555	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	10382492	49588639	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	49618868	75747214	2	1
TCGA-VQ-A8E3	4	75754649	77200325	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	77202421	78570690	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	78572069	87372478	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	87372593	88334111	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	88344886	164928702	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	164932971	166029423	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	166031900	190106768	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	15532	620164	3	1
TCGA-VQ-A8E3	5	620371	38936529	2	1
TCGA-VQ-A8E3	5	38938223	40832580	2	2
TCGA-VQ-A8E3	5	40832911	50583264	2	1
TCGA-VQ-A8E3	5	50585283	55819370	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	55819700	56601998	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	56602029	68733037	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	68733644	75074175	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	75074943	78503370	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	78503410	81538319	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	81538410	95237034	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	95237226	97145771	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	97147776	131950596	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	131951232	136331722	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	136332095	148926709	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	148927003	151644049	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	151644491	167777170	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	167777464	169309299	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	169310446	172336659	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	172337116	174220449	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	174221580	180681853	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	180682638	181363319	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	149661	886884	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	887482	1670498	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	1670751	3232538	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	3233199	5248495	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	5251074	10823059	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	10825238	11852418	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	11852605	14665182	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	14665286	15315649	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	15316897	32300652	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	32300711	33156916	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	33157535	41751177	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	41751372	42891167	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	42894060	51913278	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	51914099	53054106	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	53056695	87333684	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	87333842	88648358	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	88648814	106672655	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	106672907	107744940	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	107748629	110308939	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	110312159	110600714	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	110603785	131243009	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	131243352	132277887	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	132278680	141892046	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	141892115	143601198	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	143604237	147580845	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	147581573	147635808	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	147636160	154907301	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	154907891	155991235	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	155992796	157129266	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	157133361	158426335	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	158427301	167073523	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	167080909	170310273	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	170310752	170741917	2	0
TCGA-VQ-A8E3	7	43259	181104	3	2
TCGA-VQ-A8E3	7	181654	7359786	2	2
TCGA-VQ-A8E3	7	7362308	9240371	3	2
TCGA-VQ-A8E3	7	9243990	47210538	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	47210633	47977993	1	0
TCGA-VQ-A8E3	7	47978507	62526945	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	62553947	80674495	2	2
TCGA-VQ-A8E3	7	80675182	85461161	3	2
TCGA-VQ-A8E3	7	85462801	104619634	2	2
TCGA-VQ-A8E3	7	104619674	106083361	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	106083464	107692902	3	1
TCGA-VQ-A8E3	7	107697558	135158106	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	135158837	135372394	1	1
TCGA-VQ-A8E3	7	135378639	136942093	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	136943552	154614871	2	0
TCGA-VQ-A8E3	7	154615255	158614983	1	0
TCGA-VQ-A8E3	7	158617900	159334314	2	0
TCGA-VQ-A8E3	8	81254	863394	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	864492	1685487	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	1685529	11393666	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	11394661	13869274	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	13869398	17007162	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	17009866	17785729	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	17785745	19368824	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	19370422	20124973	2	1
TCGA-VQ-A8E3	8	20126348	27110032	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	27112084	28369815	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	28369829	61255870	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	61258398	61758127	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	61763971	95161936	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	95163207	98478669	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	98478683	127546782	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	127546912	128974924	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	128975312	138412744	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	138412868	139950981	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	139951286	141332458	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	141332583	143882296	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	143882770	145072769	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	46587	417448	2	2
TCGA-VQ-A8E3	9	417477	593899	2	1
TCGA-VQ-A8E3	9	596826	14111173	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	14111874	14310934	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	14319510	19828237	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	19828906	32903331	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	32903444	101012207	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	101012577	101792954	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	101793034	113953473	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	113954225	114475587	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	114480319	137595185	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	137599242	138200944	2	2
TCGA-VQ-A8E3	10	26823	772911	3	2
TCGA-VQ-A8E3	10	773964	1747465	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	1747688	4791226	2	2
TCGA-VQ-A8E3	10	4792364	5680348	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	5682419	10657205	3	2
TCGA-VQ-A8E3	10	10657456	25931892	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	25932298	28536760	3	1
TCGA-VQ-A8E3	10	28543986	58701690	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	58702281	59418700	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	59419055	69632523	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	69632936	69963658	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	69968132	77769457	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	77769487	79463958	1	0
TCGA-VQ-A8E3	10	79466678	85925984	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	85928780	87503615	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	87503965	89202522	3	1
TCGA-VQ-A8E3	10	89202664	122047725	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	122048827	122706024	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	122710573	128270851	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	128275799	132313175	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	132314572	133769379	2	1
TCGA-VQ-A8E3	11	198572	13380060	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	13380862	13850190	3	0
TCGA-VQ-A8E3	11	13853966	19456447	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	19456921	20251697	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	20253110	57113854	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	57113891	57526318	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	57528391	70415037	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	70415672	71592950	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	71615907	86434959	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	86439823	87025849	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	87029214	111227552	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	111228183	111492107	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	111492436	115006957	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	115007345	117699011	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	117700136	119630310	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	119632805	120335953	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	120340503	124708386	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	124712418	127255080	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	127255271	135074876	2	0
TCGA-VQ-A8E3	12	51460	1439698	3	1
TCGA-VQ-A8E3	12	1441598	34276010	2	1
TCGA-VQ-A8E3	12	34282041	39376846	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	39387356	41033065	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	41037967	47699501	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	47708313	48017319	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	48018044	75007102	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	75008110	76184058	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	76184592	113042761	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	113044371	115671418	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	115672095	124298664	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	124300060	125622014	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	125622934	129952499	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	129952884	132826358	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	132826748	133201603	2	1
TCGA-VQ-A8E3	13	18452809	30372154	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	30372309	30715843	4	0
TCGA-VQ-A8E3	13	30715953	45529207	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	45529531	45936198	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	45936379	75147276	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	75147335	75947498	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	75947688	97761377	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	97761809	98853378	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	98854164	110100325	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	110101056	113206125	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	113206273	114342922	3	0
TCGA-VQ-A8E3	14	18225647	53336334	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	53336860	55468900	1	0
TCGA-VQ-A8E3	14	55472659	69864752	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	69864940	70192222	1	0
TCGA-VQ-A8E3	14	70192239	75009436	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	75012941	75926620	2	1
TCGA-VQ-A8E3	14	75927625	93700828	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	93703428	94642050	1	0
TCGA-VQ-A8E3	14	94642460	106877229	1	1
TCGA-VQ-A8E3	15	19811075	101928837	2	0
TCGA-VQ-A8E3	16	10777	4858955	2	1
TCGA-VQ-A8E3	16	4859313	23722830	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	23724470	24202266	2	2
TCGA-VQ-A8E3	16	24202739	78861668	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	78866694	79086397	1	0
TCGA-VQ-A8E3	16	79089679	84081674	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	84081697	85133127	2	1
TCGA-VQ-A8E3	16	85136511	88726929	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	88731220	90221127	2	1
TCGA-VQ-A8E3	17	150733	10662646	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	10662718	46038520	2	0
TCGA-VQ-A8E3	17	46038872	49864510	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	49865012	58360571	2	0
TCGA-VQ-A8E3	17	58363181	61342584	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	61344417	61521238	1	0
TCGA-VQ-A8E3	17	61523107	65527485	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	65528964	72797271	2	0
TCGA-VQ-A8E3	17	72798323	83090856	3	0
TCGA-VQ-A8E3	18	48133	644790	4	0
TCGA-VQ-A8E3	18	646075	7456673	3	0
TCGA-VQ-A8E3	18	7460381	9004773	3	2
TCGA-VQ-A8E3	18	9005537	9860981	4	1
TCGA-VQ-A8E3	18	9861158	15402409	3	1
TCGA-VQ-A8E3	18	20949392	23466234	1	1
TCGA-VQ-A8E3	18	23471398	27496251	2	1
TCGA-VQ-A8E3	18	27509337	37241025	1	0
TCGA-VQ-A8E3	18	37242740	37775799	0	0
TCGA-VQ-A8E3	18	37776611	38873235	1	0
TCGA-VQ-A8E3	18	38878289	41130039	2	0
TCGA-VQ-A8E3	18	41134479	57921908	1	0
TCGA-VQ-A8E3	18	57925244	58584472	0	0
TCGA-VQ-A8E3	18	58585107	80257174	1	0
TCGA-VQ-A8E3	19	90910	6524697	2	2
TCGA-VQ-A8E3	19	6525589	7453398	3	3
TCGA-VQ-A8E3	19	7455331	15923127	3	2
TCGA-VQ-A8E3	19	15923205	27260767	2	2
TCGA-VQ-A8E3	19	27271230	36262089	2	0
TCGA-VQ-A8E3	19	36265950	37791518	4	0
TCGA-VQ-A8E3	19	37791720	54390316	3	0
TCGA-VQ-A8E3	19	54390727	57111626	2	2
TCGA-VQ-A8E3	19	57111915	57356537	3	3
TCGA-VQ-A8E3	19	57358779	58586487	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	80664	249900	8	0
TCGA-VQ-A8E3	20	249915	5938348	6	0
TCGA-VQ-A8E3	20	5940227	12749168	5	0
TCGA-VQ-A8E3	20	12749213	13410261	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	13410355	22216615	5	0
TCGA-VQ-A8E3	20	22217048	26251172	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	26251362	44831705	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	44832801	45779789	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	45780926	48229884	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	48229911	56956249	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	56958521	63127565	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	63132152	64324800	4	0
TCGA-VQ-A8E3	21	10336543	17013678	1	0
TCGA-VQ-A8E3	21	17014442	46043313	1	1
TCGA-VQ-A8E3	21	46045257	46677045	2	1
TCGA-VQ-A8E3	22	15294545	50796027	2	0
TCGA-VQ-A8E3	X	251810	728811	2	1
TCGA-VQ-A8E3	X	733195	10537657	1	0
TCGA-VQ-A8E3	X	10539040	10683713	0	0
TCGA-VQ-A8E3	X	10689747	155231360	1	0
TCGA-VQ-A8E3	X	155231872	156004181	2	0
